Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HACL1Q9UJ83 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms