Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms