Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMA1Q9UHB6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms