Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms