Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCMF1Q9P0J7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms