Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASF1BQ9NVP2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms