Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEPPQ9NTK1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms