Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPHNQ9NQX3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms