Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC52A2Q9HAB3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms