Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP3Q9H6T3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms