Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms