Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMBRA1Q9C0C7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms