Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R3Q9BXE9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R3Q9BXE9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms