Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRIP3Q9BW71 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms