Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3CQ99613 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms