Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP2Q96SN8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms