Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms