Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms