Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNDC3BQ96NL0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms