Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms