Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COG8Q96MW5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COG8Q96MW5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms