Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM20AQ96MK3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM20AQ96MK3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms