Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms