Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms