Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SNX21Q969T3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX21Q969T3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms