Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms