Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSMEM1Q8WWF3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms