Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29Q8TEQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms