Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF248Q8NDW4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF248Q8NDW4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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