Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms