Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2BQ8N4Y2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms