Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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