Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP3Q8IZU3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms