Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPAP2Q8IXW5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAP2Q8IXW5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms