Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU1Q7Z7A3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms