Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCQ7RTU9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms