Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XIRP1Q702N8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms