Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPGS1Q6ZTW0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms