Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CD109Q6YHK3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD109Q6YHK3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms