Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms