Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C12orf54Q6X4T0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C12orf54Q6X4T0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms