Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBR1LQ6UX01 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms