Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms