Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF40BQ6NWY9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF40BQ6NWY9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms