Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms