Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SAMD13Q5VXD3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms