Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF3Q5VWG9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms