Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3BQ5T9A4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3BQ5T9A4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms