Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms