Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC93Q567U6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms